逆转录-聚合酶链反应RT-PCR

besoo2020-01-13  20

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逆转录-聚合酶链反应RT-PCR

逆转录-聚合酶链反应 (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)的原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。

再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。

  • 检查部位:其他
  • 科室:免疫学检验,血
  • 空腹检查:
  • 禁忌人群:
  • 参考价格:

逆转录-聚合酶链反应RT-PCR——检查细节、注意事项、步骤、结果解读

逆转录-聚合酶链反应RT-PCR——检查项目的不适宜人群:

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逆转录-聚合酶链反应RT-PCR——检查项目的注意细节:

1.在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂。

2.为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照。

3.内参的设定:主要为了用于靶RNA的定量。常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。其目的在于避免RNA定量误差、加样误差以及各PCR反应体系中扩增效率不均一各孔间的温度差等所造成的误差。

4.PCR不能进入平台期,出现平台效应与所扩增的目的基因的长度、序列、二级结构以及目标DNA起始的数量有关。故对于每一个目标序列出现平台效应的循环数,均应通过单独实验来确定。

5.防止DNA的污染:

(1)采用DNA酶处理RNA样品。

(2)在可能的情况下,将PCR引物置于基因的不同外显子,以消除基因和mRNA的共线性。

逆转录-聚合酶链反应RT-PCR——检查项目的一般步骤:

1.总RNA的提取:见相关内容。

2.cDNA第一链的合成:目前试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以GIBICOL公司提供的SuperScriptPreamplificationSystemforFirstStrandcDNASynthesis试剂盒为例。

(1)在0.5ml微量离心管中,加入总RNA1-5μg,补充适量的DEPCH2O使总体积达11μl。在管中加10μMOligo(dT)12-181μl,轻轻混匀、离心。

(2)70℃加热10min,立即将微量离心管插入冰浴中至少1min。

然后加入下列试剂的混合物:

10×PCRbuffer2μl

25mMMgCl22μl

10mMdNTPmix1μl

0.1MDTT2μl

轻轻混匀,离心。42℃孵育2-5min。

(3)加入SuperscriptⅡ1μl,在42℃水浴中孵育50min。

(4)于70℃加热15min以终止反应。

(5)将管插入冰中,加入RNaseH1μl,37℃孵育20min,降解残留的RNA。-20℃保存备用。

3.PCR:

(1)取0.5mlPCR管,依次加入下列试剂:

第一链cDNA2μl

上游引物(10pM)2μl

下游引物(10pM)2μl

dNTP(2mM)4μl

10×PCRbuffer5μl

Taq酶(2u/μl)1μl

(2)加入适量的ddH2O,使总体积达50μl。轻轻混匀,离心。

(3)设定PCR程序。在适当的温度参数下扩增28-32个循环。为了保证实验结果的可靠与准确,可在PCR扩增目的基因时,加入一对内参(如G3PD)的特异性引物,同时扩增内参DNA,作为对照。

(4)电泳鉴定:行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察结果。

(5)密度扫描、结果分析:采用凝胶图像分析系统,对电泳条带进行密度扫描。

逆转录-聚合酶链反应RT-PCR——检查项目结果解读:

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